Młody Peter Parker / Spider-Man (Tom Holland), który zadebiutował w filmie „Kapitan Ameryka: Wojna bohaterów”, zaczyna rozumieć i kontrolować nowoodkrytą tożsamość super bohatera. Po wstrząsających doświadczeniach z Avengersami, Peter wraca do domu, do cioci May (Marisa Tomei) i pod czujne oko swego nowego mentora Tony’ego Starka (Robert Downey Jr.) Mimo, że stara się wieść normalne życie, to jednak nie potrafi pozbyć się myśli, że jest jednak kimś więcej niż Spider-Manem z sąsiedztwa. Tymczasem pojawia się Vulture (Michael Keaton), groźny wróg, który zagraża wszystkiemu, co dla Petera jest ważne.