Sławny uczony, podróżnik, uczeń doktora Paj-Chi-Wo pewnego dnia dotarł na Półwysep Bajkański i zamieszkał w Klechdawie – stolicy Bajdocji. Mieszkańcy tego niezwykłego kraju opowiadali przepiękne bajki. Niestety nie można ich było w żaden sposób utrwalić – nie było bowiem atramentu, by móc je spisać. Ginęły więc w mrokach zapomnienia. Pan Kleks, oczarowany bajdockimi opowieściami, postanowił wyruszyć w podróż, by zdobyć atrament. Tak rozpoczęła się wielka przygoda, podczas której dzielni marynarze i kapitan Kleks przemierzali lądy i oceany. Czy Panu Kleksowi uda się zdobyć atrament?