Godzilla wraca, by raz jeszcze sterroryzować Tokio! Tym razem ludzie uzbrojeni są w nową broń, która otwiera "czarne dziury" w przestrzeni. Do jednej z nich chcą zwabić legendarnego jaszczura. Zamiast tego sprowadzają na ziemię plagę gigantycznych ważek. Zaczyna się bitwa, w której naprzeciw słynnego gada stają ludzie i matka krwiożerczych owadów – Megaguirus.